A Assessoria Especial de Relações Metropolitanas (CRM) visa à construção de uma agenda metropolitana comum envolvendo as Secretarias Municipais, Estaduais, as Subprefeituras, as diferentes Prefeituras da Região Metropolitana de São Paulo e os Consórcios Intermunicipais, com intuito de articular e estabelecer ações integradas nas diversas políticas públicas.

A Assessoria Especial de Relações Metropolitanas é também encarregada de acompanhar as atividades do Conselho de Desenvolvimento Metropolitano. Graças à recente eleição do Prefeito à Presidência deste Conselho, a Coordenadoria assume igualmente a tarefa de assessorá-lo, preparando pautas com a Secretaria Executiva do Governo Estadual e gerenciando as atividades e demandas advindas deste fórum.

A AERM atuará em parceria com a agenda de Relações Federativas da Secretaria no que tange às ações e convênios firmados junto ao Governo do Estado de São Paulo, ao Governo Federal e às Prefeituras da Região Metropolitana de São Paulo. A pauta internacional aparece com grande importância para a busca de referências e novos paradigmas de governança metropolitana.