Localizado na rua Capachos com rua Catulé, São Miguel Paulista, zona Leste da cidade, o CEU Três Pontes tem 11.205 m² de área construída, em um terreno de 21.000 m². O Bloco Didático foi entregue à Secretaria Municipal de Educação em janeiro de 2008, sendo composto por um Centro de Educação Infantil (CEI), uma Escola Municipal de Educação Infantil (EMEI) e uma Escola Municipal de Educação Fundamental (EMEF). Estas unidades são distribuídas em dois prédios, com refeitórios em cada um. No total, são 41 salas (9 para CEI, 9 para EMEI e 23 para EMEF) que serão utilizadas conforme a necessidade da região, incluindo laboratório de ciências, sala de informática e espaços multiuso.
Além do Bloco Didático, o CEU possui prédio do Administrativo, prédio do refeitório principal, biblioteca e telecentro, duas piscinas (semi-olímpica, e recreativa), duas quadras poliesportivas (uma coberta) e um anfiteatro com 200 lugares. As construções dos CEUs geram cerca de 350 empregos diretos.
As aulas da EMEI e da EMEF foram iniciadas em fevereiro deste ano, e da CEI em junho. Hoje, a escola atende a 1.543 crianças e a capacidade máxima é de 1.631 alunos.